17 Oct

ผลิตภัณฑ์โมเลกุลที่แตกต่างกัน

เทคนิคใหม่ในการรับ DNA ของจุลินทรีย์โดยตรงจากสิ่งแวดล้อมได้สร้างความสนใจอย่างมากในชุมชนจุลินทรีย์รวมถึงผู้ที่อยู่ร่วมกับมนุษย์ที่แข็งแรง จุลินทรีย์บางตัวผลิตโมเลกุลที่ปกป้องโฮสต์ของพวกเขาและดังนั้นจึงเป็นผู้สมัครที่จะกลายเป็นยารักษาโรค ในทศวรรษที่ผ่านมานักจุลชีววิทยาได้สร้างฐานข้อมูลขนาดใหญ่จำนวนมากของดีเอ็นเอของจุลินทรีย์

แต่ชุมชนจุลินทรีย์ประกอบด้วยจุลินทรีย์หลายร้อยหรือพันชนิดและผลิตภัณฑ์โมเลกุลที่แตกต่างกันหลายล้านตัวและจุลินทรีย์แต่ละชนิดมีแนวโน้มที่จะตายอย่างรวดเร็วหากถูกแยกออกเพื่อการศึกษา ดังนั้นการระบุโมเลกุลที่อาจเป็นตัวยาและการแยกเชื้อจุลินทรีย์ที่ผลิตออกมานั้นจำเป็นต้องใช้ความคิดสร้างสรรค์วิธีการที่เรียกว่าการขุดจีโนม สิ่งนี้เกี่ยวข้องกับการดูที่กลุ่มของยีนและพยายามอนุมานว่าโมเลกุลเหล่านี้ผลิตอะไร มันเหมือนกับการมองไปที่สายการประกอบรถยนต์และพยายามที่จะกำหนดประเภทของรถยนต์ที่สามารถสร้างได้ยผลิตภัณฑ์โมเลกุลของกลุ่มยีนนั้นเต็มไปด้วยข้อผิดพลาด เพื่อแก้ไขข้อบกพร่องนี้เขาและ Mohimani ยืมเทคนิคจากวิศวกรรมไฟฟ้าที่เรียกว่าการถอดรหัส Viterbi ซึ่งจะช่วยให้วิศวกรตรวจจับข้อความในช่องวิทยุที่มีเสียงดัง สิ่งนี้ทำให้พวกเขาสร้างเครื่องมือค้นหาที่ยอมรับข้อผิดพลาดที่สามารถค้นหาการจับคู่ระหว่างฐานข้อมูลของ DNA ของจุลินทรีย์และฐานข้อมูลที่ระบุผลิตภัณฑ์โมเลกุลโดยสเปกตรัมมวลของพวกเขา